📄 进化生物学
Are interphylum spiralian relationships resolvable?
通过对两个系统发育基因组学数据集的分析，本研究得出结论：由于起源阶段发生了爆发性的快速辐射事件，五大主要螺旋虫类群之间的进化关系仍未得到解决，这对解释寒武纪化石及关键动物性状的进化具有重要意义。
📄 Category
evolutionary biology
413 篇论文
进化生物学探索生命如何随时间变化与适应，揭示从微小基因变异到复杂物种形成的奇妙旅程。在这里，我们关注生命之树的生长脉络，解读自然选择如何塑造地球上纷繁多样的生物形态。
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下方为您呈现近期在进化生物学领域发布的最新研究论文。
📄 进化生物学
The endoderm cell trajectory of urochordate Styela clava reveals the dual developmental origin and evolution of digestive tract
通过对海鞘（*Styela clava*）进行单细胞RNA测序，本研究揭示了脊索动物消化道起源于两个具有保守调控程序的不同幼体内胚层祖细胞群体，表明胃和肠谱系具有双重进化起源。
📄 进化生物学
The evolution of genetic drift over 50,000 generations
通过对大肠杆菌长期进化实验中五万代的分析，本研究表明，驱动遗传漂变的生殖成功率方差在不同复制群体之间发生了显著且趋异的进化，从而改变了有益突变得以建立并直接影响适应性轨迹的概率。
📄 进化生物学
Bayesian inference of gene flow between sister lineages using genomic data
本文开发了一种贝叶斯理论，以克服检测姊妹谱系间基因流时面临的非标准统计挑战，并通过模拟和实证数据证明，该方法在推断渗入方面具有高统计效能和低假阳性率。
📄 进化生物学
Phylogeny and gene function integration uncovers multiple convergences in multicellular and terrestrial transitions
通过将系统发育基因组学与 508 个物种的泛函注释相结合，本研究揭示了向多细胞性和陆生生活的重大进化转变，其特征在于语义相似的生物学功能呈现出广泛的趋同富集，且这种富集通常是通过独立的基因家族扩张以及对古老正交基因的征用共同实现的。
📄 进化生物学
Ancient persistence and newfound diversity of CR1-group retrotransposons across chordates
本研究利用长读长测序技术，提供了首次全面的脊索动物门内 CR1 族群反转录转座子的分析，揭示了其古老的起源、前所未有的多样性、新颖的元件以及频繁的水平转移事件，从而重塑了我们对其进化历史的理解。
📄 进化生物学
Gene-Culture Coevolution Favours the Emergence of Traditions in Mate Choice through Conformist Social Learning
本研究表明，择偶过程中的基因-文化协同进化使得通过简单的社会学习策略即可产生持久的文化传统，从而挑战了长期以来认为复杂的从众传递对于传统形成是严格必要的这一假设。
📄 进化生物学
A Statistical Framework to Infer the Mutation Model of Tandem Repeat Variants
该论文介绍了 TRAMA，这是一个利用祖先重组图谱来准确估算突变率，并在阶梯式与两阶段突变模型之间进行选择以处理串联重复变异的计算框架。
📄 进化生物学
Inference of germinal center evolutionary dynamics via simulation-based deep learning
本文通过分析来自重复生发中心实验的数据，利用深度学习和基于模拟的推理方法，旨在确定被称为“亲和力-适应度响应函数”的、B细胞亲和力与繁殖力之间未知的关系。
📄 进化生物学
Deciphering chromosome fusion in D. miranda's neo-sex chromosome through single-copy and repetitive oligo probes
本研究整合了 OligoMiner 和 OligoY 流程，用于设计并验证新型单拷贝及重复序列寡核苷酸探针库，从而实现对米兰达果蝇（*D_rosophila miranda*）新性染色体的全面荧光原位杂交染色，在揭示易位和倒位等复杂进化机制的同时，为研究不同基因组区域的染色体动态提供了一种强大的工具。